Перенос конфигурации RouterOS с устройства на устройство возможен только через export и import. Использование бинарного файла не рекомендуется, но бывает единственным возможным способом перенести сертификаты, либо когда другого бэкапа не делалось.
Наличие бэкапов
У вас должны быть настроены бэкапы через почту, либо SSH:
Сброс нового устройства
Новое устройство должно быть полностью без настроек:
Восстановление бинарного бэкапа
Files > File

Данный способ идеально работает на той самой железке, где сделан бэкап. Перенос на другую, даже полностью идентичную может не дать ожидаемый результат, к тому могут возникнуть проблемы в виде перепутанных интерфейсов и фантомных глюков.
Восстановление экспорта бэкапа
Работает в 100%, за исключением восстановления сертификатов, об этом нужно заботиться отдельно и вести реестр установленных сертификатов.
Берем бэкап, если вы не делали автоматический, то в консоли export file=backup и перетягиваем из files на рабочий стол.

Подключаем ПК в последний порт MikroTik и входим на него через WinBox по MAC-адресу:

Подключение в последний порт даст настроить без поиска разрыва конфигурации после отвала маршрутизатора.
Открываем конфигурацию в Notepad++ и видим, что она разбита по блокам, где новый блок начинается с слеша /

Задача для первого переноса конфигурации переносить каждый блок:


Вставляем до блока /interface bridge port

После переключения можно вставлять остальные блоки конфигурации.
После переноса конфигурации настройте пароль администратора и если есть привязка по мак адресу — смените MAC на WAN порту.